MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 plasmid1

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008320	TCT	2	6	944	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951723
2	NC_008320	A	6	6	1041	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	113951723
3	NC_008320	A	6	6	1097	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	113951723
4	NC_008320	TTA	2	6	1155	1160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113951723
5	NC_008320	GAA	2	6	1173	1178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951723
6	NC_008320	A	6	6	1209	1214	100 %	0 %	0 %	0 %	113951723
7	NC_008320	CCT	2	6	1294	1299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113951723
8	NC_008320	CTA	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951723
9	NC_008320	TAAA	2	8	1456	1463	75 %	25 %	0 %	0 %	113951723
10	NC_008320	CAAA	2	8	1571	1578	75 %	0 %	0 %	25 %	113951723
11	NC_008320	GCC	2	6	1686	1691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951724
12	NC_008320	GGC	2	6	1723	1728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113951724
13	NC_008320	CTG	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951724
14	NC_008320	GA	3	6	1813	1818	50 %	0 %	50 %	0 %	113951724
15	NC_008320	AAC	2	6	1822	1827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951724
16	NC_008320	ACA	2	6	1863	1868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951724
17	NC_008320	CTT	2	6	1870	1875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951724
18	NC_008320	TAC	2	6	1888	1893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951724
19	NC_008320	TAA	2	6	1894	1899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113951724
20	NC_008320	GAAA	2	8	1928	1935	75 %	0 %	25 %	0 %	113951724
21	NC_008320	GAA	2	6	1949	1954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951724
22	NC_008320	AGA	2	6	2018	2023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951724
23	NC_008320	AAG	2	6	2041	2046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951724
24	NC_008320	TAT	2	6	2147	2152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113951725
25	NC_008320	ATC	2	6	2163	2168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951725
26	NC_008320	CAA	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951725
27	NC_008320	TTCT	2	8	2204	2211	0 %	75 %	0 %	25 %	113951725
28	NC_008320	TAG	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113951725
29	NC_008320	ACT	2	6	2238	2243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951725
30	NC_008320	ATTA	2	8	2289	2296	50 %	50 %	0 %	0 %	113951725
31	NC_008320	TTG	2	6	2353	2358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113951725
32	NC_008320	T	6	6	2371	2376	0 %	100 %	0 %	0 %	113951725
33	NC_008320	T	6	6	2438	2443	0 %	100 %	0 %	0 %	113951725
34	NC_008320	T	6	6	2473	2478	0 %	100 %	0 %	0 %	113951725
35	NC_008320	TGT	2	6	2528	2533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113951725
36	NC_008320	CT	3	6	2628	2633	0 %	50 %	0 %	50 %	113951726
37	NC_008320	TCT	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951726
38	NC_008320	T	8	8	2663	2670	0 %	100 %	0 %	0 %	113951726
39	NC_008320	TTC	2	6	2695	2700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951726
40	NC_008320	CAAT	2	8	2724	2731	50 %	25 %	0 %	25 %	113951726
41	NC_008320	AAC	2	6	2828	2833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951726
42	NC_008320	TAT	2	6	2850	2855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113951726
43	NC_008320	ACTC	2	8	3913	3920	25 %	25 %	0 %	50 %	113951727
44	NC_008320	CT	3	6	3975	3980	0 %	50 %	0 %	50 %	113951727
45	NC_008320	TAAC	2	8	4039	4046	50 %	25 %	0 %	25 %	113951727
46	NC_008320	ATC	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951728
47	NC_008320	CAA	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951728
48	NC_008320	CAT	2	6	4145	4150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951728
49	NC_008320	CTT	2	6	4218	4223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951728
50	NC_008320	GATA	2	8	4241	4248	50 %	25 %	25 %	0 %	113951728
51	NC_008320	TC	3	6	4258	4263	0 %	50 %	0 %	50 %	113951728
52	NC_008320	GAT	2	6	4265	4270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113951728
53	NC_008320	CTT	2	6	4356	4361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951728
54	NC_008320	GTG	2	6	4978	4983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113951729
55	NC_008320	TGC	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951729
56	NC_008320	GA	3	6	5010	5015	50 %	0 %	50 %	0 %	113951729
57	NC_008320	ACT	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951729
58	NC_008320	GCC	2	6	5184	5189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951729
59	NC_008320	TTGT	2	8	5228	5235	0 %	75 %	25 %	0 %	113951729
60	NC_008320	GT	3	6	5489	5494	0 %	50 %	50 %	0 %	113951730
61	NC_008320	TTC	2	6	5502	5507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951730
62	NC_008320	CCA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113951730
63	NC_008320	GCT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951730
64	NC_008320	GCT	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951730
65	NC_008320	GTT	2	6	5774	5779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113951730
66	NC_008320	CCGGA	2	10	5787	5796	20 %	0 %	40 %	40 %	113951730
67	NC_008320	CGC	2	6	5843	5848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951730
68	NC_008320	CGC	2	6	5887	5892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951730
69	NC_008320	TGC	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951730
70	NC_008320	CTT	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951730
71	NC_008320	CAA	2	6	6138	6143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951730
72	NC_008320	CTT	2	6	6183	6188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951730

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.